L’intérêt de la génomique confirmé lors de l’assemblée générale de Capgènes

L’assemblée générale de Capgènes s’est tenue le mardi 23 avril 2024 dans ses locaux de Mignaloux-Beauvoir dans la Vienne. La présentation du rapport d’activité des différentes commissions a permis de faire le bilan des années passées et de partager les perspectives 2024. Tout d’abord avec le programme Gènes Avenir, créé il y a huit ans, et qui veut proposer un ensemble de services pour une reproduction-sélection adaptée à tous.

Côté collecte de performance, les entreprises de Conseil élevage ont continué à déployer le système de management de la qualité pour s’assurer de la fiabilité des données. Elles ont aussi cherché à recueillir explicitement l’accord des éleveurs pour le traitement de leurs données d’élevage. En 2023, un peu plus de 1 500 éleveurs ont donné leur accord et la collecte se poursuit en 2024. Certains éleveurs préfèrent aussi réaliser le contrôle laitier tout seul, et ce « protocole B » a été déployé en 2023 dans une quarantaine d’élevages intéressés.

Les projets ne manquent pas pour rechercher de nouveaux phénotypes d’intérêt. « La composition fine du lait peut être analysée en routine à partir du spectre moyen infrarouge, explique Jean-Yves Rousselot, éleveur des Deux-Sèvres et président de la commission collecte de phénotypes. En région Auvergne-Rhône-Alpes, nous testons aussi un prototype avec Adice et Okteo pour peser automatiquement les chèvres et les chevrettes. » L’enregistrement de nouveau critères par les onze techniciens pointeurs est aussi facilité par une nouvelle application PocketOS.

Près de la moitié de la semence est issue de la génomique

Pour la sélection génétique, l'année 2023 a permis le déploiement de l’index fertilité et du nouvel ICC (index combiné caprin). « Nous avons décidé de ralentir un peu le progrès sur le lait pour essayer d’améliorer un peu plus vite la fertilité et surtout les cellules, explique Frédéric Baudy, éleveur dans l’Aveyron et président de Capgènes. C’est un début de sélection vers des chèvres capables d’allier production laitière de qualité et longévité. Cette nouvelle orientation de nos schémas est un exemple supplémentaire des avancées permises par la génomique. »

La génomique a aussi permis d’être plus efficace dans la production de semences. « Le nombre de boucs en quarantaine diminue, alors que celui en production augmente, évoque Yves Rouault, le futur nouveau directeur de Capgènes. Les boucs restent moins longtemps dans nos murs et ils produisent en moyenne 2 000 doses, contre 2 500 environ, il y a quelques années. » Les jeunes boucs génomiques représentent maintenant 46 % des semences mises en place. « D’ici quelques années, tous nos boucs seront issus de la génomique », prédit Frédéric Baudy.

Un euro investi permet 3,50 euros de marge

Pour améliorer la reproduction des troupeaux, « il y a toujours beaucoup de mobilisation des techniciens référents autour des protocoles limitant le recours aux hormones, apprécie Audrey Poureau, chef de projet à Capgènes. L’objectif est d’informer les inséminateurs et les éleveurs pour que chacun prenne confiance dans ces itinéraires. »

Avec 592 éleveurs « créateurs et engagés », c’est-à-dire adhérant à la fois au contrôle laitier officiel et à Capgènes, le noyau de sélection est plutôt stable avec 175 000 chèvres. Capgènes peut aussi s’appuyer sur 802 éleveurs « piliers et acteurs », adhérant au contrôle laitier, et 368 éleveurs « pionniers et promoteurs », au contrôle laitier simplifié, pour ajouter 153 000 et 69 000 chèvres dans la base de sélection. « L’engagement des éleveurs ne se fait pas du jour au lendemain, reconnaît Audrey Poureau. C’est un travail de longue haleine. »

Pour les inciter à adhérer pleinement au programme, la chef de projet rappelle qu’« un euro investi sur le contrôle laitier et Capgènes permet un gain de 3,50 euros de marge pour l’atelier ». Les performances laitières moyennes des éleveurs adhérents parlent d’eux-mêmes : 1 099 kg de lait en moyenne pour les alpines et 1 190 kg pour les saanens.

Et pour expliquer concrètement comment un éleveur peut intégrer le programme Gènes Avenir, une vidéo de promotion « Parcours de Fred » est visible en ligne sur la chaîne YouTube de Capgènes. L’an dernier, 67 000 doses ont été mises en place chez les éleveurs français, un chiffre en légère baisse par rapport à 2022 (-0,8 %). Les deux tiers concernaient la race alpine. À noter que les inséminations se font de moins en moins en désaisonnées, puisque 37 % ont eu lieu d’octobre à mai en 2023, contre 42 % en 2018.

Des résultats et des réserves solides

Cette assemblée générale avait aussi une couleur particulière avec le changement de direction. Dans son rapport moral, le président a salué le travail de Pierre Martin qui a su « porter l’esprit mutualiste collectif, optimiste et curieux qui fait la force de notre entreprise ». Frédéric Baudy a aussi salué la mobilisation des dix-huit salariés dans cette période de changement et appelé la nouvelle équipe de direction à « poursuivre la diffusion et l’amélioration du progrès génétique vers nos élevages ».

Le directeur Pierre Martin peut partir avec le sourire, car Capgènes a une structure financière saine. L’union de coopérative a réalisé l’an dernier un résultat net de 143 000 euros malgré la hausse des charges avec, par exemple, un doublement du coût de l’azote liquide en trois ans. Sur les 2,3 millions de produits d’exploitation, 863 000 euros proviennent de la vente de semences en France et 172 000 euros de la vente de semences à l’export. Le reste découle essentiellement des cotisations de ses adhérents et des subventions liées aux activités de recherche.

Les résultats ont été affectés à des réserves financières qui se doivent d’être suffisamment élevées pour faire face aux risques sanitaires. « Imaginez si on doit abattre les boucs et que l’on soit obligé de reconstituer deux séries », prévient Frédéric Baudy, en assurant que les provisions pour risque et charges sont importantes, à plus de 900 000 euros.