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Pomme de terre : la galle verruqueuse doit être détectée précocement

Déjà pratiquée pour repérer la présence d’un capricorne invasif, l’analyse des composés organiques volatils pourrait être utilisée pour détecter précocement la galle verruqueuse de la pomme de terre.

© USDA-APHIS-PPQ

La galle verruqueuse de la pomme de terre est une maladie grave provoquée par un champignon, Synchrytrium endobioticum. Des tumeurs, dues à la prolifération de cellules, se développent au niveau des lenticelles, des stolons, des parties souterraines de tige. Les tumeurs, d’abord blanchâtres, noircissent par la suite et libèrent une poudre noire de spores, qui peuvent se conserver jusqu’à 30 années dans le sol. Les attaques sont particulièrement sévères en climat froid et humide. Le champignon est donc classé comme organisme de quarantaine et entraîne des mesures de quarantaine importantes (restriction des importations de zones infestées).

La lutte passe aussi par l’emploi de plants sains et de variétés résistantes, mais il n’existe pas de lutte chimique efficace. Une fois introduite dans la parcelle, la maladie est très difficile à éradiquer. « Il est donc important de détecter précocement la présence du champignon » a souligné Sarah Vermeeren, de l’Institut de recherche sur la sûreté et la sécurité (ISF) de l’Université de Bonn-Rhine-Sieg lors d’une conférence à Fruit Logistica. Dans ce but, le laboratoire ISF a mis au point une méthode de prélèvement des composés organiques volatils émis par des plants de pomme de terre contaminés ou non par Synchrytrium endobioticum.

Analyse des composés organiques volatils

Des données sont recueillies à plusieurs stades de croissance. Les différents composés ont été séparés et analysés par spectrométrie de masse. Et grâce à l’intelligence artificielle, les chercheurs ont pu identifier les spécificités des composés organiques volatils émis par Synchrytrium endobioticum. « L’analyse des composés organiques volatils est déjà utilisée en médecine, en alimentation ou encore pour détecter la présence d’un capricorne invasif venu d’Asie dans les containers fermés arrivant en Europe, indique Sarah Vermeeren. Elle pourrait donc être utilisée pour détecter précocement la présence du champignon responsable de la galle verruqueuse de la pomme de terre. »

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