Détecter la paratuberculose avec des mélanges de fèces

L’Inrae et l’École vétérinaire de Toulouse ont testé avec succès une méthode pour établir un statut sanitaire du troupeau vis-à-vis de la paratuberculose. En analysant les mélanges d’échantillons, les coûts de diagnostic sont réduits par rapport à une multitude de tests individuels.

Des mélanges de 5, 10 ou 20 fèces ont été créés en diluant des fèces individuelles plus ou moins chargées en Mycobacterium avium ssp. Paratuberculosis, la bactérie responsable de cette maladie contagieuse, et testés en qPCR. De même, des mélanges sanguins provenant de 5 ou 10 individus ont été analysés en sérologie Elisa.

Trop de faux positifs avec la sérologie

Appliquée à des grands effectifs, la sérologie Elisa sur des mélanges s’avère décevante avec 40 à 90 % d’élevages détectés positifs à tort (faux positifs). En revanche, l’analyse qPCR appliquée à des mélanges de fèces apparaît prometteuse. Ainsi, pour des prévalences d’infection supérieures ou égales à 15 %, la probabilité de détecter des troupeaux infectés était toujours supérieure à 93 %. De plus, contrairement à la sérologie Elisa, l’analyse de fèces est envisageable même en cas de vaccination.

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0226246