Reprenant l'interface graphique des CommandCenter 4, disponibles sur les tracteurs de la série 6R, 7R, 8R et 9R, ainsi que sur les moissonneuses-batteuses de la série 700, la nouvelle console 4640 propose une navigation plus intuitive, de nouvelles fonctionnalités du système de guidage AutoTrac (création de lignes de guidage basée sur les bordures de parcelles, voies de jalonnage à espacement variable), la coupure de 255 sections, le gestion jusqu'à 5 modulations simultanées ou encore l'importation et l'exportation de données IsoXML. Cet interface permet en outre la gestion automatisée des demi-tours, le pilotage Autotrac des outils en dévers, ainsi que le partage des lignes de guidage avec d'autres machines dans la même parcelle. Outre le transfert de données via USB, cette console peut communiquer avec MyJohnDeere.com via GSM. 

Enfin, il est possible de connecter la console 4640 avec un second écran, appelé Moniteur étendu, pour ceux qui ne souhaitent pas tout regrouper sur un seul écran.